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维亚生物任德林博士:通过生物物理技术平台,助推全球创新药研发进程
时间:2021-11-24
来源:维亚生物
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【摘要】:首期维亚医药观已正式上线!任德林博士带你直击维亚生物5大生物物理技术。

11月19日,由维亚生物推出的系列专题分享直播——维亚医药观第一期已正式上线。维亚生物执行董事兼总裁任德林博士做客本期直播间,围绕“生物物理技术在创新药研发中的应用”这一主题,系统地介绍了维亚生物生物物理技术平台的优势及应用,并列举多个代表性案例进行深入阐述。

 

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蛋白质高效表达与晶体结构研究——为新药研发开启“加速键”

 

药物分子的作用靶点多为蛋白质,因此以研究生物大分子为基础的结构生物学在药物研发中发挥着重要作用。任德林博士在此介绍,维亚生物的蛋白质和结构生物学技术平台在全球拥有独特的优势。四大表达系统(大肠杆菌表达系统、昆虫表达系统、哺乳动物悬浮表达系统及酵母表达系统)充分保证了高效的蛋白表达生产能力。在蛋白晶体结构研究方面,维亚生物与全球12家光源设施保持长期合作,可确保全年无间断的收集数据。截止2021年6月30日,维亚生物累计向客户交付超过26,000个蛋白结构,研究超过1,700个独立药物靶标。迄今为止,维亚生物已经为全球逾1000家药企及生物科技公司提供蛋白及结构生物学服务,客户囊括全球十大制药公司及35家 "Fierce Biotech 15" 最具潜力生物技术公司。

 

任德林博士还列举了多个靶标的成功合作案例。在IDH2靶点案例中,其靶点结构的研究成果已发表在Sciencexpress,且目前有2款相关药物成功获得FDA批准上市。

 

 图:IDH2靶标案例

 

另一个案例中,有关PROTAC的2个研究分别发表在Journal of Medicinal Chemistry和ACS Chemical Biology。

 

图:PROTAC靶标案例

 

ASMS技术——大分子鉴定与化合物筛选的有力工具

 

ASMS技术发展于上世纪90年代中期,是传统高通量筛选技术的升级。其不依赖放射性、荧光标记或酶活性,适用于广泛的筛选形式及条件,可筛选传统方法不容易测定的靶标。维亚生物基于结构的药物发现平台,选择将超滤ASMS、超速离心ASMS和分子尺寸排阻色谱ASMS这3种技术相结合,通过维亚生物独有的化合物库,设计出了一种快速、灵活、几乎能筛选所有可溶性蛋白靶标及化合物库的自主技术平台。

 

目前,维亚生物共有4个化合物库,包括拥有数千个化合物的片段化合物库、GPCR集中化合物库、共价化合物库以及规模达20万的结构多样性化合物库,覆盖的结构类型范围极广。


任德林博士表示,维亚生物具有完善的基于质谱技术的大分子鉴定与化合物筛选平台,亲和力质谱累计筛选超200个蛋白靶标,每年可完成超40个靶点的筛选。


任德林博士以多个成功案例深入阐述了基于质谱技术平台。如维亚生物基于ASMS筛选平台实现6个月从筛选到共晶,1年到先导化合物,3年到临床前候选化合物的记录。

 

图:ASMS平台案例

 

此外,任德林博士还介绍了HDX质谱技术的发展历程及应用领域,并通过Sirt1激动剂的成功合作案例(研究成果目前已发表在Nature Communications),进一步诠释了HDX质谱技术的广泛应用。

 

图:Sirt1激动剂案例

 

SPR技术——助攻新药研发多个环节

 

表面等离子共振技术(SPR)经过20年来的发展, 已成为生命科学及制药领域中重要的研究工具,用来检测、分析生物传感芯片上配位体与分析物之间的相互作用情况。任德林博士表示,目前SPR技术覆盖了新药研发的多个环节,在大分子、小分子、临床前及生产中都得到了广泛的应用。维亚生物目前拥有Biacore S200、Biacore 8K及样品制备的一系列自动化配套设备。


直播中,任德林博士以A-B-A Injection Binding Assay为例,详细地解释了如何应用SPR技术准确地判断两个化合物是否结合在同一个位点及其动力学参数。

图:A-B-A Injection Binding Assay案例

 

冷冻电镜技术——蛋白复杂结构的破局者

 

近年来冷冻电镜技术获得长足发展,可对重要蛋白进行原子分辨率成像,目前已广泛应用于基于结构设计的新药研发(SBDD)。

 

冷冻电镜作为蛋白复杂结构的破局者,是否会取代X-射线衍射技术,在业界引发了争议。对此,任德林博士作出了客观解析——两者间各有优势。X射线技术已发展成熟,结构解析通量高,成本低,但是其对样品要求高,通常只适用于单一纯化蛋白,膜蛋白和大的蛋白复合物结构解析非常困难,且蛋白结构只能在体外进行测定,缺乏人体环境真实性;而冷冻电镜可以为过去不适合结晶的蛋白提供高分辨率结构,包括大型动态复合体及膜蛋白。在接近天然、完全水合的状态下可以进行数据收集,获得生理状态下的蛋白结构。 

 

最后,任德林博士介绍,维亚生物冷冻电镜平台具备从Negative Stained EM(复染)到Cryo Sample Screening(筛选),再到Data collection & processing(结构解析)的全流程服务能力,并通过2组蛋白复杂结构案例,进一步论述了维亚冷冻电镜的多方面应用。

 

图:冷冻电镜结构案例

 

维亚医药观


维亚医药观是由维亚生物推出的系列专题分享直播平台,将邀请生物医药行业专家分享CRO、CMC及CDMO领域的前沿研究与成功经验。内容覆盖蛋白质晶体结构研究、生物物理技术、药物化学、抗体研发、药学研究、绿色化学、药品注册申报及GMP生产等多个热门方向。维亚医药观致力于聚焦全球生物医药产业前沿研究,与业界人士共话行业发展动向,助力生物医药创新者药物研发及生产。

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